MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata plasmid pFSYMDG01

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015664	GGC	2	6	10	15	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015664	CGGC	2	8	60	67	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015664	C	6	6	87	92	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_015664	CAG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015664	GCGG	2	8	163	170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015664	CG	5	10	279	288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015664	CGGA	2	8	304	311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015664	CAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015664	ACCC	2	8	334	341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_015664	C	6	6	4534	4539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_015664	CCG	2	6	4552	4557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015664	G	6	6	4557	4562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015664	GT	3	6	4569	4574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015664	CCCCT	2	10	4575	4584	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
15	NC_015664	CCG	2	6	4585	4590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015664	GCG	2	6	4664	4669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015664	C	6	6	4715	4720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_015664	GC	3	6	4788	4793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015664	GC	3	6	4827	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015664	GCCG	2	8	4926	4933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015664	GCCG	2	8	4944	4951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015664	GCCG	2	8	4962	4969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015664	GGC	2	6	4996	5001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015664	GCG	2	6	5074	5079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015664	GGT	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015664	GC	3	6	5101	5106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015664	CG	4	8	5134	5141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015664	CG	3	6	5173	5178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015664	CG	3	6	5338	5343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015664	GGT	2	6	5516	5521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015664	TCG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015664	TCC	2	6	5974	5979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015664	GCT	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015664	ATCTT	2	10	6019	6028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015664	GGTT	2	8	6501	6508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015664	GCC	2	6	6635	6640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015664	CCG	2	6	8746	8751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015664	TGC	2	6	9232	9237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015664	CT	4	8	9238	9245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015664	GTGG	2	8	9265	9272	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015664	GGGTC	2	10	10867	10876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015664	GGTC	2	8	10891	10898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015664	G	6	6	10912	10917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015664	TCG	2	6	11152	11157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015664	CCT	2	6	11158	11163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015664	CGA	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015664	GCGA	2	8	11271	11278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015664	CGGGTG	2	12	11291	11302	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015664	GCCG	2	8	11306	11313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015664	CG	3	6	11312	11317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015664	CGGCG	2	10	11362	11371	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015664	GGC	2	6	11372	11377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015664	AGG	2	6	12280	12285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015664	ACGCGA	2	12	12300	12311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.